研究生教育是中國科學院大學人才培養的主體，以科教融合為特色，以培養高層次、高素質創新創業人才為目標。截至2020年底，中國科學院重慶綠色智能技術研究院已累計授予160名研究生碩士、博士學位。目前，在學研究生540余名，其中博士研究生約占34%。

　　國科大研究生教育面向國家戰略需求、面向世界科技前沿的大科學工程、服務社會各行業進步發展的豐富科研項目，各級重點實驗室等科研平臺及由院士、千人計劃、杰青等高水平師資隊伍，通過集中教學校區的課程教學和研究所科研實踐的“兩段式”培養模式，實施“統一招生、統一教育管理、統一學位授予”和“院所融合的領導體制、師資隊伍、管理制度、培養體系”。中國科學院重慶綠色智能技術研究院學術學位研究生培養覆蓋了理學、工學2個學科門類的4個博士一級學科、5個碩士一級學科；專業學位研究生培養覆蓋了電子信息、材料與化工、資源與環境3個專業學位類別。國科大的研究生教育具有歷史傳承的科教融合的教育體系，為有志于從事科學研究的青年才俊成長成才提供了堅實基礎和保障。